Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms