Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ubash3bQ8BGG7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ubash3bQ8BGG7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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