Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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