Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SREBF2Q12772 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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