Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms