Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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