Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms