Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN8AQ9UQD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms