Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt1Q9JMD1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms