Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm1Q9JLF6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tgm1Q9JLF6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm1Q9JLF6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms