Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE1Q9HBF4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE1Q9HBF4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFYVE1Q9HBF4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms