Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab27aQ9ERI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab27aQ9ERI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab27aQ9ERI2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms