Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DA42 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9DA42 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9DA42 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9DA42 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DA42 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DA42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DA42 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9DA42 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DA42 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DA42 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DA42 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DA42 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DA42 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DA42 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DA42 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DA42 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DA42 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DA42 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DA42 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DA42 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DA42 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DA42 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DA42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DA42 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DA42 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DA42 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DA42 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DA42 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DA42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DA42 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DA42 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DA42 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DA42 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DA42 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9DA42 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9DA42 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9DA42 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DA42 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DA42 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DA42 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DA42 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DA42 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms