Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkiras2Q9CR56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras2Q9CR56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras2Q9CR56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms