Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sf3b1Q99NB9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sf3b1Q99NB9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b1Q99NB9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms