Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU3

FNBP1, Formin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP1Q96RU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNBP1Q96RU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNBP1Q96RU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNBP1Q96RU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms