Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C17orf53Q8N3J3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf53Q8N3J3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf53Q8N3J3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms