Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vwa8Q8CC88 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vwa8Q8CC88 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vwa8Q8CC88 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms