Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rft1Q8C3B8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rft1Q8C3B8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms