Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best2Q8BGM5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Best2Q8BGM5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms