Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd200r4Q6XJV4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200r4Q6XJV4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms