Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcaf3Q6QR59 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf3Q6QR59 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf3Q6QR59 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms