Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18Q62280 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18Q62280 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18Q62280 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18Q62280 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18Q62280 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18Q62280 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18Q62280 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ss18Q62280 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18Q62280 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18Q62280 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18Q62280 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms