Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stxbp3Q60770 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp3Q60770 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms