Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf15Q5UBV8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms