Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW25

Pom121l2, POM121-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121l2Q5SW25 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pom121l2Q5SW25 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pom121l2Q5SW25 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pom121l2Q5SW25 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pom121l2Q5SW25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pom121l2Q5SW25 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pom121l2Q5SW25 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pom121l2Q5SW25 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms