Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ceacam5Q3UKK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ceacam5Q3UKK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ceacam5Q3UKK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ceacam5Q3UKK2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ceacam5Q3UKK2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ceacam5Q3UKK2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ceacam5Q3UKK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.5 ms