Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hs1bp3Q3TC93 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hs1bp3Q3TC93 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms