Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rspo3Q2TJ95 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms