Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF2Q12933 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms