Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERCC6Q03468 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
ERCC6Q03468 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ERCC6Q03468 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms