Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copz1P61924 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copz1P61924 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms