Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptx3P48759 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms