Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac1P41539 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac1P41539 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac1P41539 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms