Protein–RNA interactions for Protein: P40889

YJL225C, Y' element ATP-dependent helicase YJL225C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL225CP40889 YLR407WYLR407W 687 nt5.48□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 GDA1YEL042W 1557 nt5.48□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 PDR10YOR328W 4695 nt5.48□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 MTM1YGR257C 1101 nt5.47□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 LOH1YJL038C 660 nt5.47□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 SNF8YPL002C 702 nt5.47□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 CTS2YDR371W 1536 nt5.47□□□□□ -1.53
YJL225CP40889 TAF5YBR198C 2397 nt5.46□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 SNT1YCR033W 3681 nt5.46□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 ATF1YOR377W 1578 nt5.46□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 COQ4YDR204W 1008 nt5.46□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 MKK1YOR231W 1527 nt5.46□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 MNT2YGL257C 1677 nt5.46□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 PAL1YDR348C 1500 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 CAF16YFL028C 870 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YFL068WYFL068W 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 FUR1YHR128W 651 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 CSR1YLR380W 1227 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YPR059CYPR059C 387 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 CWH43YCR017C 2862 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 GCR1YPL075W 2358 nt5.45□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YIL001WYIL001W 1542 nt5.44□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 NAT2YGR147C 867 nt5.44□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 HSP150YJL159W 1242 nt5.44□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YKL023WYKL023W 834 nt5.44□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 HST4YDR191W 1113 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YGL072CYGL072C 360 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 CYM1YDR430C 2970 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 DPH1YIL103W 1278 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 EFB1YAL003W 621 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 BUB3YOR026W 1026 nt5.42□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YEL020CYEL020C 1683 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YER158CYER158C 1722 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 RPS14AYCR031C 414 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 PER33YLR064W 822 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 SEC72YLR292C 582 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 YPL162CYPL162C 822 nt5.41□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 MRS3YJL133W 945 nt5.4□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 RMI1YPL024W 726 nt5.4□□□□□ -1.54
YJL225CP40889 ALT2YDR111C 1524 nt5.4□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.39□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 UBX2YML013W 1755 nt5.39□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 LSG1YGL099W 1923 nt5.39□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 ENP1YBR247C 1452 nt5.39□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 MST1YKL194C 1389 nt5.39□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 RCR2YDR003W 633 nt5.39□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 IMA3YIL172C 1770 nt5.38□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 IMA4YJL221C 1770 nt5.38□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 KRE6YPR159W 2163 nt5.38□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YIR007WYIR007W 2295 nt5.37□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.37□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 VPS68YOL129W 555 nt5.37□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 CRT10YOL063C 2874 nt5.37□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 SLX1YBR228W 915 nt5.37□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 PCS60YBR222C 1632 nt5.36□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 MET16YPR167C 786 nt5.36□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 SPC105YGL093W 2754 nt5.36□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 HIS4YCL030C 2400 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YJR096WYJR096W 849 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 GMH1YKR030W 822 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YOR300WYOR300W 309 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 MPH2YDL247W 1830 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YFR006WYFR006W 1608 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 LTV1YKL143W 1392 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 SSL1YLR005W 1386 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 PAH1YMR165C 2589 nt5.35□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 BUD13YGL174W 801 nt5.34□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 MCM1YMR043W 861 nt5.34□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 EAR1YMR171C 1653 nt5.34□□□□□ -1.55
YJL225CP40889 YHR173CYHR173C 339 nt5.34□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 LDB19YOR322C 2457 nt5.34□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 APM2YHL019C 1818 nt5.33□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 HAP1YLR256W 4509 nt5.33□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 YDR282CYDR282C 1245 nt5.33□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 CDC12YHR107C 1224 nt5.33□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 KIN4YOR233W 2403 nt5.33□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 TRS120YDR407C 3870 nt5.32□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 YGL199CYGL199C 471 nt5.32□□□□□ -1.56
YJL225CP40889 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms