Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2aP34056 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms