Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pola1P33609 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pola1P33609 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pola1P33609 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms