Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms