Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav1P27870 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vav1P27870 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vav1P27870 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vav1P27870 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vav1P27870 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms