Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb4P10284 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms