Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb2P0C1T1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb2P0C1T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms