Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc8P09025 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms