Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NGFRP08138 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NGFRP08138 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NGFRP08138 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NGFRP08138 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NGFRP08138 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NGFRP08138 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NGFRP08138 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NGFRP08138 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NGFRP08138 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms