Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ItgamP05555 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms