Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly86O88188 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly86O88188 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly86O88188 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly86O88188 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly86O88188 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly86O88188 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms