Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
ABCC9O60706 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
ABCC9O60706 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
ABCC9O60706 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC9O60706 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC9O60706 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC9O60706 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC9O60706 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC46.3■■■■■ 5
ABCC9O60706 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC46.3■■■■■ 5
ABCC9O60706 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
ABCC9O60706 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
ABCC9O60706 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
ABCC9O60706 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC9O60706 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC9O60706 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC9O60706 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC9O60706 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC9O60706 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC9O60706 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
ABCC9O60706 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
ABCC9O60706 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
ABCC9O60706 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
ABCC9O60706 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
ABCC9O60706 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
ABCC9O60706 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
ABCC9O60706 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
ABCC9O60706 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
ABCC9O60706 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCC9O60706 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms