Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc179J3QM76 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc179J3QM76 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms