Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3072F6SKY8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms