Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms