Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPED1A4D0V7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms